在4S店更换发动机的费用因多种因素而异，但大致可以确定的是，费用通常在 2万到5万元之间。具体费用会受到以下因素的影响：
车型：
不同车型的发动机价格差异较大。普通轿车的发动机更换价格大约在2万到3万元之间，而高端车型如奔驰、宝马、奥迪等，发动机价格可能达到5万到6万元甚至更高。
损坏程度：
轻微的故障如更换火花塞或空气滤清器，费用可能在几百元到一千多元人民币；如果是更复杂的维修，如缸体修复或更换活塞，费用可能在几千到数万元不等。
零部件成本：
不同品牌和型号的汽车，其零配件价格差异大。进口车的配件通常价格较高，而国产车的便宜一些。
维修店：
正规的4S店或专业维修中心会提供详细的价格清单，但价格通常会高于街边维修店。
地区差异：
不同地区的汽车修理价格可能会有所不同，一线城市通常会比二线或三线城市稍高。
保修情况：
如果车辆还在保修期内，通常可以享受免费或低价的维修服务。
因此，建议在更换发动机时，车主应选择正规的4S店进行更换，以确保维修质量和配件的安全性。同时，车主可以根据具体车型、损坏程度以及所在地区等因素，提前咨询当地4S店或专业维修店，以获取更准确的报价。
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